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妊娠期间，药物可影响母体内分泌、代谢等，间接影响胚胎、胎儿；也可通过胎盘屏障直接影响胎儿。最严重的药物毒性是影响胚胎分化和发育，导致胎儿畸形和功能障碍，这与用药时的胎龄密切相关。（1）妊娠前期：应防止妇女可能在妊娠前已接触过有致畸危险的药物，甚至父体用药，药物通过精子或精液影响胚胎的正常发育造成后代致畸的可能。（2）着床前期(受精后2周内)：着床前期是指卵子受精至受精卵着床于子宫内膜前的这段时期、此期的受精卵与母体组织尚未直接接触，还在输卵管腔或宫腔分泌液中，胚胎发育正处于细胞增殖早期，细胞还没有进行分化，药物损害常导致极早期流产，如只有部分细胞受损，补偿机制可使胚胎继续发育而不发生后遗问题，故如在此期曾短期服用少量药物，不必过分忧虑。（3）晚期囊胚着床后至12周左右：妊娠12周内是药物致畸最敏感的时期，是胚胎、胎儿各器官处于高度分化迅速发育、不断形成的阶段，首先是心脏、脑开始分化发育，随后是眼、四肢等，药物损害可影响器官形成，导致畸形，药物毒性作用出现越早，发生畸形可能越严重，所以用药要特别慎重。(4）妊娠12周至分娩：胎儿各器官已分化完成，药物致畸作用明显减弱，但对于尚未分化完全的器官，某些药物还可能对其产生影响，使胎儿发育迟缓或造成某些功能缺陷，如胎儿牙齿、生殖系统，而神经系统因在整个妊娠期间持续分化发育，药物对神经系统的影响可以一直存在。（5）分娩期：分娩活动虽属正常生理过程，但在分娩过程中出现产妇的并发症，并发症或胎儿出现宫内窘迫，此时均需用药，亦应注意药物对胎儿的影响，如产程中镇痛，不宜选用呼吸抑制作用强的吗啡类镇痛药，哌替啶是分娩镇痛常用的药物，因其镇痛2～3小时达峰，持续4小时，故让胎儿在用药后1小时内或4小时后娩出为好，让出生时新生儿体内的药物处于低水平。妊娠期间用药原则妊娠期用药需有明确指征，应采用疗效肯定，不良反应小且已清楚的老药，并且注意用药时间、疗程和剂量的个体化，必要时需测定血药浓度以及时调整剂量。对尚未搞清是否有致畸危险的新药，尽量避免使用；小剂量有效地避免用大剂量；单药有效地避免联合用药(对致病菌不明的重症感染患者使用抗菌药时例外)；用药时需清楚地了解妊娠周数，在妊娠前3个月是胚胎器官形成期，应尽量避免使用药物，如应用可能对胎儿有影响的药物时，要权衡利弊以后再决定是否用药，若确实病情需要，也不应过于顾虑而延误母体必要的治疗需求，因为一些疾病，如糖尿病、癫痫的惊厥发作、子宫内感染(如梅毒)等也有致畸的可能，若病情急需，应用肯定对胎儿有危害的药物，则应先终止妊娠后再用药。